皇岗口岸大楼改建后，港方口岸区面积将由14万平方米增至40万平方米，香港将有全面司法管辖权，负责清关、出入境、检疫等。

香港保安局局长李家超表示，预计新皇岗口岸的主体工程最早可望于2023年年底完成，

在新口岸接近落成时，两地政府会向全国人大常委会提请批准实施“一地两检”，港府也会就此进行本地立法工作。

皇岗新口岸日后将沿用目前深圳湾口岸的“一地两检”通关模式，特区政府将会在新皇岗口岸大楼内设立港方口岸区，并行使全面司法管辖权，以香港特区法律办理清关、出入境及检疫检查。这将大大提高口岸通关效率，令往来港深的人流车流更为快捷顺畅。

　　中港物流行业的头部物流企业——飞龙世纪物流了解到，皇岗口岸╱落马洲管制站是深港两地之间最繁忙的陆路口岸之一，在疫情之前也是深港之间唯一24小时运作的口岸。但李家超坦言，该口岸已营运超过40年，部分设施已老化，两地的旅检大楼并非直接相连，旅客需转乘接驳巴士往来两个口岸。

深圳市政府在2019年提出在原址重建皇岗口岸的计划，并且建议在新口岸实施“一地两检”，为此，两地政府成立了一个领导小组，由深圳市常务副市长及香港保安局局长共同主持，以深化有关讨论。

根据深圳市政府公布的资料显示，新皇岗口岸的交通规划引入深广中轴城际轨道、穗莞深城际轨道、地铁20号线及预留港铁北环线支线接入条件，未来皇岗口岸将成为辐射大湾区、面向世界的超级口岸和综合交通枢纽。相信“一地两检”的通关模式，将大大提高口岸通关效率，令往来港深的人流车流更为快捷顺畅。